MySQL имеет множество настроек связанных с кодировками, что может приводить к проблемам, например, при переносе БД с сервера на сервер, когда кодировки MySQL исходного и целевого серверов отличаются. Но в большинстве случаев, эти проблемы достаточно легко решаются.
В файле my.cnf (по умолчанию ) существует достаточно много настроек, которые влияют на быстродействие MySQL, при этом универсального рецепта нет. На серверах, где много оперативной памяти, можно попробовать уменьшить количество операций с жестким диском (которые будут выполняться дольше и потреблять…